纤维束过滤器运行一段时间后偏要进行反冲洗，来确保过撼出水水质，反冲洗方式通常有两种：单水反冲洗和气、水联合反冲洗。为确定纤维球除油反应器合理的反冲洗方式，在反冲水强度为10L/m'、反冲洗时间为20min的情况下，首先进行单水反冲洗.然后保持反冲水强度和时间不变，从零渐加大反冲气强度至30 L/m，进行气、水联合反冲洗.并分别侧定不同反冲洗情况下的反冲试验发现，对改性纤维球进行单洗效果并不理想，即纤维球过滤污水的周期甚至是石英砂滤料的50倍以上，由于不需要频繁地进行反冲洗，所以，纤维球过滤运行非常便捷稳定．并且可以减少工作量。

      反冲洗是为恢复滤池正常工作所采用的反向水流冲洗滤层的操作过程。操作时，水流经底部排水系统反向通过滤池，以冲洗掉滤料中的堵塞物质，并减少产生水头损失的因素。不同类型的滤池具有不同的反冲强度与反冲时间，对于快滤池反冲强度为36-54m/h，反冲洗时间为5-10min，滤层膨胀率达40%-50%。另外，在采用离子交换法处理水或废水时，以及树脂再生操作前也需先进行反冲洗，其目的在于松动树脂层和去除树脂层中的杂质、破碎颗粒等。
       纤维球过滤可以进行气、水同时反冲洗，通过气体的强烈搅动作用使悬浮颗粒脱离滤料表面进入水体，随着反冲洗水而流出滤池，从而节省大量的反冲洗水量，由于纤维球过滤池上方设有多孔板，能够防止滤料随着反冲洗水流失，反冲洗需要有足够的冲洗强度和水头，如果有难以洗掉的附着物，需加合适的清洗剂反冲洗的水要迅速排除，可以回流至污水来路，如果遇到特殊状况，反冲洗时间要根据实际情况确定，不能太长，小心冲散滤料。